根据《中华人民共和国个人所得税法》规定，工资收入超过5000元的，应当按照税率表缴纳个人所得税。起征点为每月应纳税所得额的3500元，即每月应纳税所得额超过3500元的，其超出部分应缴纳个人所得税。税率表如下：
1、应纳税所得额不超过3500元的，免征个人所得税；
2、应纳税所得额超过3500元至5000元的，税率3%；
3、应纳税所得额超过5000元至8000元的，税率10%；
4、应纳税所得额超过8000元至17000元的，税率20%；
5、应纳税所得额超过17000元至30000元的，税率25%；
6、应纳税所得额超过30000元至40000元的，税率30%；
7、应纳税所得额超过40000元至60000元的，税率35%；
8、应纳税所得额超过60000元的，税率45%。
因此，工资收入超过5000元的，应当按照上述税率表缴纳个人所得税，起征点为每月应纳税所得额的3500元。税收缴纳的具体流程，一般是由纳税人自行计算应纳税额，然后按期缴纳税款，或者由纳税人的单位代为缴纳。